monai保存nii图像及其注意事项详解

monai保存nii图像及其注意事项详解 2023-11-20 594

monaI中保存图像主要使用的是 monai.transforms.SaveImage 或 monai.transforms.SaveImaged 接口。

基本用法

import monai.transforms as mt
save_image = mt.SaveImage()

# 假设image是已读取到的 monai.data.MetaTensor
save_image(image)

裁剪了图像，为什么保存的图像大小仍然没变？这是由于没有指定是 resample 参数为 False 造成的 image_cropped = crop(image) # 此时保存的图像就是裁剪的了 save_image = mt.SaveImage(resample=False) save_image(image_cropped)
怎么才能输出到指定文件夹里面？指定 output_dir 参数
保存的图像老是会保存到新创建的文件夹中怎么办？指定 separate_folder=False 即可 save_image = mt.SaveImage(separate_folder=False) save_image(image)
怎么指定文件名后缀？指定 output_postfix=name 即可 # 不指定后缀 save_image = mt.SaveImage(output_postfix=) save_image(image)
我有一堆图像，我想分别把他们裁剪过后的图像保存到不同的文件夹下怎么办？使用偏函数 from functools import partial import monai.transforms as mt saver = partial( mt.SaveImage, resample=False, separate_folder=False ) for image in 这堆图像: saver(output_dir=path)(image)