linux下pfam使用方法,pfam数据库介绍及使用
一个基因转录的蛋白质分子中可以包含多个结构特异并且功能不同的区域，这些区域称之为domain，domain 可以看作蛋白质功能的基本单位，蛋白质的功能由包含的多个domain共同决定，研究domain, 可以更好的研究蛋白质功能，而具有相同结构域的基因往往形成一个基因家族。
pfam数据库介绍：
Pfam数据库是蛋白质家族的数据库，根据多序列比对结果和隐马尔可夫模型，将蛋白质分为不同的家族。网址如下
http://pfam.xfam.org/
在该数据库中，提供了以下3个不同层级蛋白质家族信息。
1.family
每个family以PF编号唯一标识，所有的family可以分为以下6种类型：
Family
A collection of related protein regions
Domain
A structural unit
Repeat
A short unit which is unstable in isolation but forms a stable structure when multiple copies are present
Motifs
A short
一个基因转录的蛋白质分子中可以包含多个结构特异并且功能不同的区域，这些区域称之为domain，domain 可以看作蛋白质功能的基本单位，蛋白质的功能由包含的多个domain共同决定，研究domain, 可以更好的研究蛋白质功能，而具有相同结构域的基因往往形成一个基因家族。 pfam数据库介绍： Pfam数据库是蛋白质家族的数据库，根据多序列比对结果和隐马尔可夫模型，将蛋白质分为不同的家族。网址如下 http://pfam.xfam.org/ 在该数据库中，提供了以下3个不同层级蛋白质家族信息。 1.family 每个family以PF编号唯一标识，所有的family可以分为以下6种类型： Family A collection of related protein regions Domain A structural unit Repeat A short unit which is unstable in isolation but forms a stable structure when multiple copies are present Motifs A short