r roc函数_时间依赖性ROC曲线(二)
引文
R语言实践
本文采用“survivalROC”包进行时间依赖性ROC曲线的绘制。“survivalROC”包中内置了时间依赖性ROC曲线绘制的数据集mayo。mayo数据集包含312条数据,每条数据包含time (event time/censoring time), censor (censoring indicator), mayoscore4, mayoscore5四个信息。 首先我们导入包和数据:
library(survivalROC) data(mayo) cutoff <- 365library(survivalROC) data(mayo) cutoff <- 365
其中cutoff即为在前文提到的时间t。 其次我们使用“survivalROC”包提供的survivalROC函数处理数据。survivalROC函数会返回cut.values、TP以及FP等用于ROC曲线绘制的信息。
Mayo4.2= survivalROC(Stime=mayo$time,
status=mayo$censor,
marker = mayo$mayoscore4,
predict.time = cutoff,
method="KM") Mayo4.2= survivalROC(Stime=mayo$time, status=mayo$censor, marker = mayo$mayoscore4, predict.time = cutoff, method="KM")
然后根据surviva
引文 R语言实践 本文采用“survivalROC”包进行时间依赖性ROC曲线的绘制。“survivalROC”包中内置了时间依赖性ROC曲线绘制的数据集mayo。mayo数据集包含312条数据,每条数据包含time (event time/censoring time), censor (censoring indicator), mayoscore4, mayoscore5四个信息。 首先我们导入包和数据: library(survivalROC) data(mayo) cutoff <- 365 其中cutoff即为在前文提到的时间t。 其次我们使用“survivalROC”包提供的survivalROC函数处理数据。survivalROC函数会返回cut.values、TP以及FP等用于ROC曲线绘制的信息。 Mayo4.2= survivalROC(Stime=mayo$time, status=mayo$censor, marker = mayo$mayoscore4, predict.time = cutoff, method="KM") 然后根据surviva